Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 B230303A05Rik-201ENSMUST00000220672 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm14273-201ENSMUST00000136315 1786 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Znf48Q3US17 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm11239-201ENSMUST00000171348 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm11237-201ENSMUST00000178319 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm11236-201ENSMUST00000180092 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Znf48Q3US17 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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