Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms