Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx7-204ENSMUST00000121489 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Thsd1-203ENSMUST00000162447 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Sun1-206ENSMUST00000110884 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37155-201ENSMUST00000192152 406 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan5b-201ENSMUST00000072662 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Lrit3-202ENSMUST00000185462 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 4930554H23Rik-201ENSMUST00000181327 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnt1-215ENSMUST00000200434 3609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19144-201ENSMUST00000221921 1859 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gapdhs-201ENSMUST00000074758 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Slc36a1os-202ENSMUST00000157010 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Chid1-201ENSMUST00000026586 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd12b-206ENSMUST00000182927 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmem52b-204ENSMUST00000204741 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Hcar1-201ENSMUST00000164267 3285 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Pex12-201ENSMUST00000018877 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17322-201ENSMUST00000181289 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Suv39h1-202ENSMUST00000115637 2778 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 A930005G22Rik-201ENSMUST00000201293 1904 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms