Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Usp39Q3TIX9 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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