Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Trim71Q1PSW8 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim71Q1PSW8 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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