Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pkp1P97350 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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