Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Sh3bp1P55194 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Sh3bp1P55194 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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