Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprkP35822 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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