Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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