Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms