Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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