Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gjb1P28230 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms