Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RhoP15409 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
RhoP15409 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
RhoP15409 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
RhoP15409 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
RhoP15409 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
RhoP15409 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms