Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
P10404 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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P10404 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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P10404 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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P10404 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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P10404 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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P10404 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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P10404 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
P10404 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
P10404 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
P10404 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
P10404 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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