Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms