Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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TtrP07309 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TtrP07309 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TtrP07309 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TtrP07309 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TtrP07309 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TtrP07309 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TtrP07309 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms