Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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Ccl20O89093 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Ccl20O89093 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Ccl20O89093 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Ccl20O89093 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Ccl20O89093 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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