Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms