Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms