Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms