Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
NubplQ9CWD8 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NubplQ9CWD8 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms