Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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