Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Olfr1320-201ENSMUST00000096449 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Q9CRC3 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Q9CRC3 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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