Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Usp27Q8CEG8 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Usp27Q8CEG8 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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