Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Cldn17Q8BXA6 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Cldn17Q8BXA6 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms