Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Chsy1Q6ZQ11 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms