Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc88cQ6VGS5 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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