Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms