Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccdc18Q640L5 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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