Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Apoc1-201ENSMUST00000045035 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9770-201ENSMUST00000075147 811 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a8-201ENSMUST00000022787 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 AC153526.3-201ENSMUST00000220145 2183 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Spdl1-201ENSMUST00000093191 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Teddm2-201ENSMUST00000059607 1654 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc41-205ENSMUST00000219108 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15931-201ENSMUST00000118066 1852 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne8-202ENSMUST00000064391 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Mink1-204ENSMUST00000102558 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf43-201ENSMUST00000040089 3670 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Smok3b-202ENSMUST00000166206 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gtpbp6Q3U6U5 Lin7a-201ENSMUST00000020057 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42847-201ENSMUST00000201732 2553 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd19-202ENSMUST00000167294 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 A230059L01Rik-201ENSMUST00000126596 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Gtpbp6Q3U6U5 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp949-203ENSMUST00000161458 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18640-201ENSMUST00000209777 2165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm43-206ENSMUST00000165313 1975 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Htr1d-202ENSMUST00000117699 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Wdhd1-202ENSMUST00000111792 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Cd22-201ENSMUST00000019248 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Sgpl1-201ENSMUST00000092498 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37702-201ENSMUST00000194357 1872 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms