Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rpusd3Q14AI6 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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Rpusd3Q14AI6 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rpusd3Q14AI6 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms