Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Mc1rQ01727 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms