Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Sh3bp1P55194 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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