Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxc11P31313 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxc11P31313 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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