Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprmP28828 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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