Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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