Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms