Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
H2-Q1O19441 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms