Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PtprbB2RU80 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PtprbB2RU80 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
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PtprbB2RU80 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
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PtprbB2RU80 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprbB2RU80 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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