Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Grik3B1AS29 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Grik3B1AS29 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms