Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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