Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Trim12aQ99PQ1 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Trim12aQ99PQ1 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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