Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdcl3Q8BVF2 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdcl3Q8BVF2 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdcl3Q8BVF2 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdcl3Q8BVF2 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdcl3Q8BVF2 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdcl3Q8BVF2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms