Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Dsg1bQ7TSF1 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Dsg1bQ7TSF1 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Dsg1bQ7TSF1 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Dsg1bQ7TSF1 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Dsg1bQ7TSF1 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Dsg1bQ7TSF1 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms