Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Ccdc88cQ6VGS5 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc88cQ6VGS5 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms