Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Sft2d1Q5SSN7 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Sft2d1Q5SSN7 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sft2d1Q5SSN7 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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