Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Q3U6N9 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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