Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rps29P62274 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms