Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn18P56857 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms