Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sh3bp1P55194 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms